Dataset

DZNE-2022-01805

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Dataset: Summary statistics for 'Exome sequencing identifies rare damaging variants in ATP8B4 and ABCA1 as risk factors for Alzheimer's Disease'

Holstege, H. ; Hulsman, M. ; Charbonnier, C. ; Grenier-Boley, B. ; Quenez, O. ; Grozeva, D. ; van Rooij, J. G. J. ; Sims, R. ; Ahmad, S. ; Amin, N. ; Norsworthy, P. J. ; Dols-Icardo, O. ; Hummerich, H. ; Kawalia, A. ; database, A. D. N. I. (ADNI) ; Amouyel, P. ; Beecham, G. W. ; Berr, C. ; Bis, J. C. ; Boland, A. ; Bossù, P. ; Bouwman, F. ; Bras, J. ; Campion, D. ; Nicholas Cochran, J. ; Daniele, A. ; Dartigues, J.-F. ; Debette, S. ; Deleuze, J.-F. ; Denning, N. ; DeStefano, A. L. ; Farrer, L. A. ; Fernandez, M. V. ; Fox, N. C. ; Galimberti, D. ; Genin, E. ; Gille, H. ; Guen, Y. L. ; Guerreiro, R. ; Haines, J. L. ; Holmes, C. ; Arfan Ikram, M. ; Kamran Ikram, M. ; Jansen, I.Extern* ; Kraaij, R. ; Lathrop, M. ; Lemstra, A. W. ; Lleó, A. ; Luckcuck, L. ; Mannens, M. M. A. M. ; Marshall, R. ; Martin, E. R. ; Masullo, C. ; Mayeux, R. ; Mecocci, P. ; Meggy, A. ; Mol, M. O. ; Morgan, K. ; Myers, R. M. ; Nacmias, B. ; Naj, A. C. ; Napolioni, V. ; Pasquier, F. ; Pastor, P. ; Pericak-Vance, M. A. ; Raybould, R. ; Redon, R. ; Reinders, M. J. T. ; Richard, A.-C. ; Riedel-Heller, S. G. ; Rivadeneira, F. ; Rousseau, S. ; Ryan, N. S. ; Saad, S. ; Sanchez-Juan, P. ; Schellenberg, G. D. ; Scheltens, P. ; Schott, J. M. ; Seripa, D. ; Seshadri, S. ; Sie, D. ; Sistermans, E. ; Sorbi, S. ; Spaendonk, R. v. ; Spalletta, G. ; Tesi, N. ; Tijms, B. ; Uitterlinden, A. G. ; van der Lee, S. J. ; Visser, P. J. d. ; Wagner, M.DZNE* ; Wallon, D. ; Wang, L.-S. ; Zarea, A. ; Clarimon, J. ; van Swieten, J. C. ; Greicius, M. ; Yokoyama, J. S. ; Cruchaga, C. ; Hardy, J. ; Ramirez, A.DZNE* ; Mead, S. ; van der Flier, W. M. ; Duijn, C. M. v. ; Williams, J. ; Nicolas, G. ; Bellenguez, C. ; Lambert, J.-C.

2022
Zenodo

This record in other databases:  

Please use a persistent id in citations: doi:10.5281/ZENODO.6818051  doi:10.5281/zenodo.6818050  doi:10.5281/zenodo.6818051

Abstract: These are the burden test results (summary statistics) for the publication: 'Exome sequencing identifies rare damaging variants in ATP8B4 and ABCA1 as risk factors for Alzheimer’s Disease', Nature Genetics, 2022. Format: tab-separated-value. Fields: gene_stable_id: Ensembl gene id gene_name: standard gene name pvalue: burden test significance (likelihood ratio test, population structure correction based on 6 PCA components) cmac_all: sum of minor allele dosages across all contributing samples and variants group: variant group (LOF, LOF+REVEL>=75, LOF+REVEL>=50, LOF+REVEL>=25, see publication methods for further selection criteria). beta/se: beta/se of logistic ordinal regression (see publication methods). Positive = risk-increasing. Negative = risk-decreasing.

Keyword(s): Alzheimer's disease ; Exome sequencing ; Burden test

---

Contributing Institute(s):

1. Patient Studies Bonn (Patient Studies Bonn)
2. Neuropsychology (AG Wagner)

Research Program(s):

1. 353 - Clinical and Health Care Research (POF4-353) (POF4-353)

Appears in the scientific report 2022

---

---

Linked articles:

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article Holstege, H. ; Hulsman, M. ; Charbonnier, C. ; et al
Exome sequencing identifies rare damaging variants in ATP8B4 and ABCA1 as risk factors for Alzheimer's disease.
Nature genetics 54(12), 1786 - 1794 (2022) [10.1038/s41588-022-01208-7]2022   Files  Fulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

---